La Fundación CIEPE fue creada el 7 de julio de 1973, bajo un concepto de mejorar la participación de productos nacionales en el mercado internacional.

Desde 2006 con su integración al Mnisterio del Poder Popular para la Ciencia, Tecnología e Innovación, se ha convertido en un instrumento de lucha para alcanzar la Soberanía tecnológica y alimentaria del país, prestando servicios de análisis técnicos, generando conocimientos científicos, desarrollando tecnologías agroindustriales e incorporando saberes e innovaciones populares.